主条目：拳皇系列角色列表
系列中，《拳皇'94》独立成章“KOF序章”（KOF開幕編），草薙流古武术传人草薙京(Kyo Kusanagi)与爱出风头的二阶堂红丸(Benimaru Nikaido)、以及柔道奥运金牌得主大门五郎(Goro Daimon)组成队伍出战“拳皇”大会。主办者路卡爾(Rugal)其中愛好是收藏銅像，會將其擊敗的對手鑄造銅像並收藏。路卡爾从大赛中吸引高手，然后亦想利用他的身体来铸造铜像，最后他們在路卡爾的基地，京粉碎了路卡爾的野心及計劃，路卡爾則按下啟動器令基地毀滅並失去了蹤影。
《拳皇'95》至《拳皇'97》为“大蛇篇”（オロチ編），主角同样为草薙京。事件源於大蛇一族意圖復活他們的主、地球的意志之一「大蛇」，並令世界毀滅。路卡爾在背後再次舉辦拳皇大賽，主角草薙京與兩名好友二階堂紅丸及大門五郎再度組隊參賽，另一位三神器後代的八神家年輕當家八神庵(Iori Yagami)組織了勁敵隊參賽。路卡爾在赛事中使用了大蛇之力，最後因力量失控自取滅亡。其后，最後一位三神器後代的神樂家年輕女當家神樂千鶴(Chizuru Kagura)被人控制舉辦了拳皇大賽，大賽完結後，八神庵因大蛇力量首次暴走，在無意識下重創了自己的隊員。大蛇(Orochi)逐漸重生，最終由草薙京、八神庵、神樂千鶴三位三神器的後代成功合力封印了大蛇，大蛇篇故事至此暫告一段落。
《拳皇'99》至《拳皇2001》为“音巢篇(N.E.S.T.S.篇)”（ネスツ編），主角為被組織NESTS改造而失去了所有記憶的K'（K Dash），这个神秘組織不斷進行人體改造實驗及捕获了草薙京进行生化克隆人实验。主角K'為了追尋自己的過去，決定背叛組織並參加組織舉辦的拳皇大賽。大賽結束後，意圖背叛組織並利用組織兵器控制世界使用音巢對流拳武術的複製零(Cloned Zero)現身，K'等人阻止並擊敗複製零，成功解救一次危機，複製零則被組織以背叛之罪處決。之后，NESTS因為首腦之子伊格尼斯（Igniz）的篡位而令組織逐步走向滅亡。专门为克制K'所研究的女改造人绰号庫拉(Kula Diamond)亦開始思考自己過去，最後決定與其隊友們背叛組織。眾人遇上認為能夠主宰世界、使用音巢對流拳武術的伊格尼斯，他意圖利用太空基地達到想隨意控制世界，最終由K'及庫拉等人合力擊倒。伊格尼斯因與事願違，決定留下跟NESTS太空基地一同毀滅。
《拳皇2003》、《拳皇XI》和《拳皇XIII》为“艾森篇”（アッシュ編），這次故事主角為背景完全神秘及操作著翠炎的艾森‧古立遜（Ash Crimson）。“遙遠彼之地”的成員無界(Mukai)現身，並聲明要解封大蛇，神樂、草薙京、八神庵兩人阻止失手，艾森偷走八尺之鏡后消失。其后，遙遠彼之地成員紫苑(Shion)及禍忌(Magaki)進一步解封大蛇，被艾森等人擊敗。這時八神因大蛇力量暴走，重創了京及真吾(Shingo Yabuki)二人。不久，艾森反常地擊敗暴走八神庵，並且奪去八神庵的神器八尺琼勾玉，并宣稱有意在下次大賽之時會奪走草薙京的三神器草薙之劍。其后，大賽由路卡爾之女兒蘿絲·班舒泰爾(Rose Bernstein)舉辦，目的是利用大賽實踐計劃復活遙遠彼之地之主，並且令齋祀(Saiki Crimson)自己的家族得以復活及令其餘人類消失。最终，艾森打败了齋祀，道出自己是為了令齋祀確信，所以才奪走了兩個神器獲取其信任。正當艾森眼見齋祀身體沒反應之際，齋祀透過殘留在艾森體內的冥炎的個人意識發動了冥炎之氣令到艾森反被力量吞噬，艾森用自我意志成功擺脫控制，但自己亦跟著消失。
《拳皇XIV》為KOF新篇、系列新章、官方暫無任何正式篇章名稱，現時暫定以「KOF新篇」（KOF新編）作為稱呼。本作追加新篇章關鍵人物、操作神秘鬼影能量的中國少年-瞬影(Shun'Ei)，與其師傅及師弟組隊參賽新一次KOF大賽。其師傅為桃李滿門的唐福祿(Tung Fu Ru)，屢次參賽的有名格鬥家-餓狼隊的泰瑞·柏格(Terry Bogard)、南鎮隊的基斯·哈瓦特(Geese Howard)也是他的徒弟之一。聽從師傳建議，與其師弟明天君(Meteikun)及師傳本人參賽增廣見識。本作舉辦者為對外稱首任冠軍的安東諾夫(Antonov)，他舉辦賽事的本意為找尋眾多格鬥家聚首比拼，並且與勝出的格鬥家對壘，如戰勝了他就可以奪走身上的拳皇冠軍腰帶作為勝出獎勵及榮譽。於大賽末段安東諾夫被勝出的參賽隊伍打敗後天色突然變幻，疑為靈魂能量集合體的威爾斯（Verse）出現並且毀壞了本次大會主場地，而威爾斯伴隨各靈魂能量的出現導致瞬影與其產生能量上的「共嗚」，令瞬影感到暈眩及後出現短時間昏迷失去反應。隨着眾人擊倒威爾斯，令威爾斯出現力量失控奔向天空，然後直接從能量爆炸自身意志消失於空中，其能量分散在世界各地，在賽後由各方有意人士追蹤情況。